RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R5EQ16537 467 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 KAZNQ674X7 775 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 AADACL2Q6P093 401 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CEP76Q8TAP6 659 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SNX19Q92543 992 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 GGT7Q9UJ14 662 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GTW7 788 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 FTCDO95954 541 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 BNC1Q01954 994 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TFDP2Q14188 446 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZNF235Q14590 738 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 GRM3Q14832 879 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ODF2Q5BJF6 829 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 NEK5Q6P3R8 708 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 NOD2Q9HC29 1040 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 AMFRQ9UKV5 643 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.53■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PYGMP11217 842 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CCNB1P14635 433 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RWDD2BP57060 319 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 COPS2P61201 443 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ZNF284Q2VY69 593 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ALG1LQ6GMV1 187 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 PEX26Q7Z412 305 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 CCNYQ8ND76 341 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 RAB7BQ96AH8 199 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HES6Q96HZ4 224 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 IL12RB2Q99665 862 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 HEMGNQ9BXL5 484 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 NT5MQ9NPB1 228 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 ITM2BQ9Y287 266 aa22.52■■□□□ 1.2
SYF2-201ENST00000236273 SPTBN4Q9H254 2564 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQU0 124 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 KRT86O43790 486 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 CCDC175P0C221 793 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 GNSP15586 552 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PTPN7P35236 360 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 NR2C2P49116 596 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 AP1S1P61966 158 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 FGL2Q14314 439 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PDK1Q15118 436 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 BBS12Q6ZW61 710 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TTC7BQ86TV6 843 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 HORMAD1Q86X24 394 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 CNTD1Q8N815 330 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa22.51■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 KCNK1O00180 336 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 WNT1P04628 370 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 CFIP05156 583 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DQB2P05538 268 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ENGP17813 658 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TGM2P21980 687 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LMNB2Q03252 620 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB17Q13105 803 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 UGP2Q16851 508 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ARRDC2Q8TBH0 407 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SPOCK2Q92563 424 aa22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms