RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641260.1

SAMMSON-210, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,308 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-210ENST00000641260 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CLNKQ7Z7G1 428 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC9B2Q86UD5 537 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKFN1Q8N957 763 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 IPMKQ8NFU5 416 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GLG1Q92896 1179 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PTP4A1Q93096 173 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RFKQ969G6 155 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MARC2Q969Z3 335 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MAGED4Q96JG8 741 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SERPINI1Q99574 410 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DCLK3Q9C098 648 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RGS18Q9NS28 235 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LUZP4Q9P127 313 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RAB23Q9ULC3 237 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DENND2AQ9ULE3 1009 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GDAQ9Y2T3 454 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MYH6P13533 1939 aa6.26□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RAB19A4D1S5 217 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRAF5O00463 557 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 AIM2O14862 343 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PLD2O14939 933 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TEX33O43247 280 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PIP5K1CO60331 668 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DFNA5O60443 496 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 EDF1O60869 148 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DNAJA2O60884 412 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RBBP9O75884 186 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 NDST3O95803 873 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 URODP06132 367 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 FURINP09958 794 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TAC1P20366 129 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PIK3R1P27986 724 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CD40LGP29965 261 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ERP29P30040 261 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ECHS1P30084 290 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CHRNA5P30532 468 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ACSL1P33121 698 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HTR2BP41595 481 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CASP3P42574 277 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 IL12RB1P42701 662 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 BTDP43251 543 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CAPZA2P47755 286 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 FNTBP49356 437 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SEPHS1P49903 392 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 HK3P52790 923 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 AQP4P55087 323 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DEFA1P59665 94 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DEFA3P59666 94 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PPARAQ07869 468 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 MGAT5Q09328 741 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 STX5Q13190 355 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ADAM15Q13444 863 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 CUL2Q13617 745 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TRIP10Q15642 601 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 TAB1Q15750 504 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SGCAQ16586 387 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 PFKFB4Q16877 469 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SFT2D3Q587I9 215 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 LDLRAD1Q5T700 205 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.25□□□□□ -1.41
SAMMSON-210ENST00000641260 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.25□□□□□ -1.41
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