RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640799.1

C1orf43-210, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene C1orf43, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-210ENST00000640799 GPR27Q9NS67 375 aa18.08■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PKD1L2Q7Z442 2459 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 A6NNZ2 444 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.484e-16■■■■□ 23.8
C1orf43-210ENST00000640799 TSPAN6O43657 245 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SIGLEC6O43699 453 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 FTLP02792 175 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 C1SP09871 688 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 GIMD1P0DJR0 217 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PSMA2P25787 234 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 NR1I3Q14994 352 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CYTH1Q15438 398 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PROX2Q3B8N5 592 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PARP15Q460N3 678 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ZNF542PQ5EBM4 170 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 LRRC73Q5JTD7 316 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 GDPD4Q6W3E5 623 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 TMPRSS12Q86WS5 348 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PEBP4Q96S96 227 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 LRRC19Q9H756 370 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 AREL1O15033 823 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 INSIG1O15503 277 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PIAS2O75928 621 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SKILP12757 684 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CKMT2P17540 419 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ITIH2P19823 946 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PRKCIP41743 596 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 TPI1P60174 286 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 RHOAP61586 193 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 FAM174AQ8TBP5 190 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 EXOC2Q96KP1 924 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 LHX3Q9UBR4 397 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ITPR1Q14643 2758 aa18.06■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 J3KR12 359 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 NEMP1O14524 444 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 FFAR2O15552 330 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 IGSF6O95976 241 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 GZMAP12544 262 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CYP4F3Q08477 520 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 KLHL30Q0D2K2 578 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SGCGQ13326 291 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 FZD2Q14332 565 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ERMARDQ5T6L9 678 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 TTC7BQ86TV6 843 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 OR4C6Q8NH72 309 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PDFQ9HBH1 243 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SERPINC1P01008 464 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 CDK4P11802 303 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 JUPP14923 745 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 TIMP2P16035 220 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 DESP17661 470 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ACP1P24666 158 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 HTR7P34969 479 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 NDST2P52849 883 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 RAD51Q06609 339 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 ASB12Q8WXK4 309 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 IFT43Q96FT9 208 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 EDEM3Q9BZQ6 932 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SLC39A8Q9C0K1 460 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 DKK4Q9UBT3 224 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 KLF15Q9UIH9 416 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 RAXQ9Y2V3 346 aa18.04■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 SYCE3A1L190 88 aa18.03■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 FPGTO14772 594 aa18.03■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PRAMEF11O60813 436 aa18.03■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 MMP20O60882 483 aa18.03■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 PIGNO95427 931 aa18.03■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 MIPP30301 263 aa18.03■□□□□ 0.48
C1orf43-210ENST00000640799 RABIFP47224 123 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms