RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637791.1

MECP2-223, Transcript of methyl-CpG binding protein 2, human

TSL 5

Gene MECP2, Length 101 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MECP2-223	ENST00000637791	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZNF197	O14709	1029 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	INSIG1	O15503	277 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TBC1D4	O60343	1298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NPHS1	O60500	1241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SIN3B	O75182	1162 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	XYLB	O75191	536 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	VPS4B	O75351	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	VPS26A	O75436	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CRCP	O75575	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SOAT2	O75908	522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ABLIM3	O94929	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ITGB1	P05556	798 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	C2	P06681	752 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	THRA	P10827	490 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TPH1	P17752	444 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	HDC	P19113	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SAT1	P21673	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PRDX6	P30041	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CD86	P42081	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ETV4	P43268	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TTPA	P49638	278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PTPN5	P54829	565 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	AQP5	P55064	265 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	STX1B	P61266	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	AP1S1	P61966	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PPARD	Q03181	441 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	GAD2	Q05329	585 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	BST1	Q10588	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MTM1	Q13496	603 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CDH18	Q13634	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	BMPR2	Q13873	1038 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MPP2	Q14168	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MAP7	Q14244	749 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ACAP2	Q15057	778 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CRY1	Q16526	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PCSK7	Q16549	785 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MPPE1	Q53F39	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MPP7	Q5T2T1	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	NPW	Q8N729	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	TOP1MT	Q969P6	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ISL2	Q96A47	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	ACD	Q96AP0	544 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MECP2-223	ENST00000637791	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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