RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.52□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 V9GYQ6 96 aa6.52□□□□□ -1.36
PDE4D-228ENST00000636120 MYH7P12883 1935 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 USP12O75317 370 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF682O95780 498 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GSNP06396 782 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ITGB6P18564 788 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6V1B2P21281 511 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GRIA4P48058 902 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PEX6Q13608 980 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CYP1B1Q16678 543 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TEX44Q53QW1 395 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ATAD3BQ5T9A4 648 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM136AQ96C01 138 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC9A7Q96T83 725 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TRMOQ9BU70 441 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SNX15Q9NRS6 342 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PADI3Q9ULW8 664 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PLCH1Q4KWH8 1693 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 USP54Q70EL1 1684 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PCSK2P16519 638 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DRD4P21917 467 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PIK3R1P27986 724 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GPR15P49685 360 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ERFP50548 548 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 EPS8Q12929 822 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SLC30A9Q6PML9 568 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SNX32Q86XE0 403 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TDRPQ86YL5 185 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RBFAQ8N0V3 343 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KRT78Q8N1N4 520 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SVOPQ8N4V2 548 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PHF21AQ96BD5 680 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MAGED4Q96JG8 741 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MYH6P13533 1939 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ARL5CA6NH57 179 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 E9PAM4 449 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GPR25O00155 361 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RPP40O75818 363 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 UNC5CO95185 931 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OTCP00480 354 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 L1CAMP32004 1257 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 GRK4P32298 578 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 VAC14Q08AM6 782 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CES5AQ6NT32 575 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 TPGS1Q6ZTW0 290 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 USP6NLQ92738 828 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP42Q96MM3 310 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LGMNQ99538 433 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CDH19Q9H159 772 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SDCBP2Q9H190 292 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 RHOJQ9H4E5 214 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BBIP1A8MTZ0 92 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LRCH4O75427 683 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 WFS1O76024 890 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 EPN2O95208 641 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LDLRP01130 860 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MYBL2P10244 700 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 WEE1P30291 646 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 S100A3P33764 101 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CDH4P55283 916 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 BNIP2Q12982 314 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 DDR2Q16832 855 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SYT12Q8IV01 421 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 FAM126BQ8IXS8 530 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MYO19Q96H55 970 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 CORO1BQ9BR76 489 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 SYT17Q9BSW7 474 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 HIPK3Q9H422 1215 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PRR23AA6NEV1 266 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 WDR47O94967 919 aa6.52□□□□□ -1.37
PDE4D-228ENST00000636120 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
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