RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LZTR1	Q8N653	840 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CFLAR	O15519	480 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GRID2	O43424	1007 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SOAT2	O75908	522 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CNTN5	O94779	1100 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HMBS	P08397	361 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GLDC	P23378	1020 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PIK3R1	P27986	724 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DSG1	Q02413	1049 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF33A	Q06730	810 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NEPRO	Q6NW34	567 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	POTEH	Q6S545	545 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MIB1	Q86YT6	1006 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FKBP6	O75344	327 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJB2	P25686	324 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CD86	P42081	329 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	OR1G1	P47890	313 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CD151	P48509	253 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CSRP3	P50461	194 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ARPP19	P56211	112 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	USP46	P62068	366 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ALF	Q53S48	1182 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ARTN	Q5T4W7	220 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	IRGC	Q6NXR0	463 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TARM1	B6A8C7	271 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ARSA	P15289	507 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PAM	P19021	973 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	HOXC13	P31276	330 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ETFB	P38117	255 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	INHBE	P58166	350 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CDC16	Q13042	620 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PRKAA1	Q13131	559 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DSC3	Q14574	896 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	PSMD5	Q16401	504 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ACAD11	Q709F0	780 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	B3GALT6	Q96L58	329 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GPR78	Q96P69	363 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TREX1	Q9NSU2	369 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	METTL21C	Q5VZV1	264 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SCML4	Q8N228	414 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RDH11	Q8TC12	318 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB11	Q96P15	392 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ZIC5	Q96T25	663 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CDYL	Q9Y232	598 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	MAP3K13	O43283	966 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTS4	O75173	837 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	GJB3	O75712	270 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	CPB1	P15086	417 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BRF1-222	ENST00000635152	RAG1	P15918	1043 aa		13.22	□□□□□ -0.29

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