RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.62■■□□□ 1.537e-7■■□□□ 11.5
CAPNS1-216ENST00000628306 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SKA1Q96BD8 255 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINB11Q96P15 392 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-25P01717 112 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 HNF1BP35680 557 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 DNA2P51530 1060 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX35Q5T0J7 233 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 EXD1Q8NHP7 514 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 FRS2Q8WU20 508 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 MAIP1Q8WWC4 291 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD7Q92527 254 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TENM4Q6N022 2769 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SART1O43290 800 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ADH1BP00325 375 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PYGMP11217 842 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 DESP17661 470 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMA2P25787 234 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 NUMBP49757 651 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 COPS2P61201 443 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 HADHQ16836 314 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RCOR2Q8IZ40 523 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 LGI2Q8N0V4 545 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A7Q92504 469 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 SARDHQ9UL12 918 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF462Q96JM2 2506 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TK2O00142 265 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF8O76064 485 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 GJB6O95452 261 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT7P08729 469 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 GPD1P21695 349 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CETN2P41208 172 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PROX2Q3B8N5 592 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 BEND5Q7L4P6 421 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 MFSD2AQ8NA29 543 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 FGGP02679 453 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PDGFRAP16234 1089 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TACR2P21452 398 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 MCM3P25205 808 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN9P43378 593 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 LONRF2Q1L5Z9 754 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 PCSK4Q6UW60 755 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG14Q96F25 216 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB21Q9UL25 225 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-216ENST00000628306 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 KRIT1O00522 736 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPN7P35236 360 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCKSL1P49006 195 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 TAS2R40P59535 323 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ILKQ13418 452 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR93Q6P2C0 686 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CPNE8Q86YQ8 564 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CAAP1Q9H8G2 361 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 AK5Q9Y6K8 562 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 HSF2BPO75031 334 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 LRCH4O75427 683 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 IL1BP01584 269 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 CKMT2P17540 419 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ACP1P24666 158 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 PLK1P53350 603 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 C19orf57Q0VDD7 668 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 AGBL4Q5VU57 503 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52K2Q8NGK3 314 aa24.56■■□□□ 1.52
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