RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	COX7A2	P14406	83 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MPPE1	Q53F39	396 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ALF	Q53S48	1182 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ELFN1	P0C7U0	828 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NEK3	P51956	506 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SYN3	O14994	580 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MAGEC1	O60732	1142 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ULK1	O75385	1050 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	BANF1	O75531	89 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MLYCD	O95822	493 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PBX1	P40424	430 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CRHR2	Q13324	411 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NOMO1	Q15155	1222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TEX44	Q53QW1	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CNST	Q6PJW8	725 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	OR4L1	Q8NH43	312 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MYOC	Q99972	504 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RHBG	Q9H310	441 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SGTA	O43765	313 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	PIAS1	O75925	651 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SHBG	P04278	402 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	CDRT15	Q96T59	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	CHKB	Q9Y259	395 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	LRCH4	O75427	683 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	LGR5	O75473	907 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	DNTT	P04053	509 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	TCF3	P15923	654 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	NUP107	P57740	925 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	USP7	Q93009	1102 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	PWWP2A	Q96N64	755 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SYBU	Q9NX95	663 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	TMCO1	Q9UM00	188 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	PEX11A	O75192	247 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	LDLR	P01130	860 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SPIDR	Q14159	915 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SNX27	Q96L92	541 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	NUDT14	O95848	222 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	PARP15	Q460N3	678 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	TPD52L3	Q96J77	140 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	RNF145	Q96MT1	663 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	ALOX15B	O15296	676 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	GRM6	O15303	877 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	EPN2	O95208	641 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	C22orf31	O95567	290 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	NTS	P30990	170 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	GNA13	Q14344	377 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB18-208	ENST00000611151	NCF4	Q15080	339 aa		13.88	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms