RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PPARDQ03181 441 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PAK1Q13153 545 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TPRG1LQ5T0D9 272 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 RAB11FIP2Q7L804 512 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 VPS36Q86VN1 386 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 DRC7Q8IY82 874 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 OR6K2Q8NGY2 324 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 C1orf74Q96LT6 269 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TBATAQ96M53 351 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TIGD1Q96MW7 591 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TBCBQ99426 244 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 LRRC61Q9BV99 259 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 IL17BQ9UHF5 180 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ITM2BQ9Y287 266 aa15.48■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 KRIT1O00522 736 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 JMJD7P0C870 316 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CTSEP14091 401 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TSHRP16473 764 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SLC9A1P19634 815 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ETFBP38117 255 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 BLKP51451 505 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GNA12Q03113 381 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ELOCQ15369 112 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 FOXR2Q6PJQ5 311 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GBP6Q6ZN66 633 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF683Q8IZ20 524 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ARL10Q8N8L6 244 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ASB12Q8WXK4 309 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SGF29Q96ES7 293 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SEPT10Q9P0V9 454 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GGT7Q9UJ14 662 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 HPCAL4Q9UM19 191 aa15.47■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SCN8AQ9UQD0 1980 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 BIN1O00499 593 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 YY2O15391 372 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 UGT2B4P06133 528 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ALPIP09923 528 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 UGT1A5P35504 534 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ABL2P42684 1182 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PDX1P52945 283 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 YPEL5P62699 121 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ARF5P84085 180 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 XKR5Q6UX68 686 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 MACC1Q6ZN28 852 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ATG14Q6ZNE5 492 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 TTC7BQ86TV6 843 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 EXD3Q8N9H8 876 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 SHC3Q92529 594 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 EXTL1Q92935 676 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 HAPLN3Q96S86 360 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 ACTL7AQ9Y615 435 aa15.46■□□□□ 0.07
ACTN4-211ENST00000589528 D6RAR5 112 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 I6L893 689 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 TOR1BO14657 336 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 CASC3O15234 703 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 ZMPSTE24O75844 475 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 TM7SF2O76062 418 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 GKP32189 559 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 IGFALSP35858 605 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 INHBCP55103 352 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 TCEA2Q15560 299 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 EXOC3L4Q17RC7 722 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF354CQ86Y25 554 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.45■□□□□ 0.06
ACTN4-211ENST00000589528 CENPTQ96BT3 561 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms