RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589104.5

KDM4B-208, Transcript of lysine demethylase 4B, human

TSL 2

Gene KDM4B, Length 3,470 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KDM4B-208	ENST00000589104	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CEP70	Q8NHQ1	597 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LZTS1	Q9Y250	596 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104		A0A1B0GTW7	788 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TRIM38	O00635	465 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ACOX3	O15254	700 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ERCC2	P18074	760 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	HPCA	P84074	193 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KDELC1	Q6UW63	502 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SPRED1	Q7Z699	444 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TFAP2C	Q92754	450 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MRGBP	Q9NV56	204 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MAFK	O60675	156 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CD151	P48509	253 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GALK1	P51570	392 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	IKBKE	Q14164	716 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GRIK4	Q16099	956 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MPP4	Q96JB8	637 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	FXYD1	O00168	92 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	INPPL1	O15357	1258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PRSS23	O95084	383 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CCNC	P24863	283 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LILRA4	P59901	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SNX32	Q86XE0	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	VWA8	A3KMH1	1905 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104		E9PQ18	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CD4	P01730	458 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MMP2	P08253	660 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	GPX3	P22352	226 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PML	P29590	882 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TYK2	P29597	1187 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SULT1E1	P49888	294 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CDC42EP1	Q00587	391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SLC12A1	Q13621	1099 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RCN3	Q96D15	328 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	RILP	Q96NA2	401 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MID2	Q9UJV3	735 aa		13.56	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MYL3	P08590	195 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CDK9	P50750	372 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	C1QTNF8	P60827	252 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MAP7	Q14244	749 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104		A0A087X1B8	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104		E9PBE3	544 aa		13.55	□□□□□ -0.24
KDM4B-208	ENST00000589104	KLHL41	O60662	606 aa		13.55	□□□□□ -0.24

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