RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 MACC1Q6ZN28 852 aa22.13■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 CMKLR1Q99788 373 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 FUCA2Q9BTY2 467 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.13■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 MPP6Q9NZW5 540 aa22.13■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXJ2Q9P0K8 574 aa22.13■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF606Q8WXB4 792 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ASB12Q8WXK4 309 aa22.12■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ARHGEF26Q96DR7 871 aa22.12■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 GNA15P30679 374 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ETV5P41161 510 aa22.11■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 CENPTQ96BT3 561 aa22.11■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQ27 194 aa22.1■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PQC6 194 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 KRIT1O00522 736 aa22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 GKP32189 559 aa22.1■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 ENPP7Q6UWV6 458 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa22.08■■□□□ 1.13
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CAPNS1-205ENST00000588780 LMO3Q8TAP4 145 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 EPAS1Q99814 870 aa22.08■■□□□ 1.13
CAPNS1-205ENST00000588780 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.08■■□□□ 1.13
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