RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588200.1

PKN1-211, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 548 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-211	ENST00000588200	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	FZD3	Q9NPG1	666 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200		U3KQA8	63 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200		K7ESM1	405 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	FPGT	O14772	594 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	SPINT1	O43278	529 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ABCG1	P45844	678 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	SGCG	Q13326	291 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ACAP1	Q15027	740 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	SYCP1	Q15431	976 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	PARP15	Q460N3	678 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	FGF11	Q92914	225 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	CNPY3	Q9BT09	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	DNAI1	Q9UI46	699 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200		H3BM21	787 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	RAD51B	O15315	384 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	FGF10	O15520	208 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	OPA1	O60313	960 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	MT-CO3	P00414	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ACTN2	P35609	894 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ABL2	P42684	1182 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	DNA2	P51530	1060 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	DAB2	P98082	770 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	MYL5	Q02045	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	RAD51	Q06609	339 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	PTK2B	Q14289	1009 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	GRM3	Q14832	879 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	AGER	Q15109	404 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	BAP1	Q92560	729 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	AGPAT1	Q99943	283 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	MYOC	Q99972	504 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	PRORY	Q9H606	182 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PKN1-211	ENST00000588200	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	IGLON5	A6NGN9	336 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	TK2	O00142	265 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	KRIT1	O00522	736 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	CCP110	O43303	1012 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	TMCC1	O94876	653 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	EPHB2	P29323	1055 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	CSNK1D	P48730	415 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	PEX5	P50542	639 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	CLDN6	P56747	220 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	SERINC3	Q13530	473 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	NCAPH	Q15003	741 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	EFHC2	Q5JST6	749 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	EPAS1	Q99814	870 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	AQP9	O43315	295 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PKN1-211	ENST00000588200	BRINP1	O60477	761 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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