RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 WIPF3A6NGB9 483 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 H3BRJ5 948 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 H7C0C1 242 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PSMD3O43242 534 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 BRINP1O60477 761 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HUS1O60921 280 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC6O75061 913 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 F9P00740 461 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 EDN1P05305 212 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 POU2F2P09086 479 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 MYL4P12829 197 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 KRT4P19013 534 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HOXA9P31269 272 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SERPINB6P35237 376 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ATP5OP48047 213 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HCAR3P49019 387 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TAF6P49848 677 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DGKEP52429 567 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 VAC14Q08AM6 782 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PDK1Q15118 436 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ZBTB6Q15916 424 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PTPRNQ16849 979 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 KIZQ2M2Z5 673 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 XKR4Q5GH76 650 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 C1QL3Q5VWW1 255 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 DHRS13Q6UX07 377 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TIFABQ6ZNK6 161 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 BEND5Q7L4P6 421 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 C11orf74Q86VG3 221 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 PLD5Q8N7P1 536 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 BANPQ8N9N5 519 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 APPL2Q8NEU8 664 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 STON2Q8WXE9 905 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TTC17Q96AE7 1141 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HIC2Q96JB3 615 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 C7orf26Q96N11 449 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 HERPUD2Q9BSE4 406 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SDCBP2Q9H190 292 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 STK39Q9UEW8 545 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.22□□□□□ -1.09
GGA3-218ENST00000584243 A8MXQ7 604 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 E5RJQ4 531 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 COPEO14579 308 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 NRP1O14786 923 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 B4GALT5O43286 388 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 CCDC22O60826 627 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 GPR32O75388 356 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 DAB1O75553 588 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 C8BP07358 591 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 PYGBP11216 843 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 CCDC130P13994 396 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 GARSP41250 739 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 CCR2P41597 374 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 MATKP42679 507 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 MAGEA3P43357 314 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 LHX1P48742 406 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 SLC18A2Q05940 514 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 SEMA5AQ13591 1074 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 KRT72Q14CN4 511 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 INSCQ1MX18 579 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 WASHC2DQ5SRD0 308 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 WLSQ5T9L3 541 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 ASRGL1Q7L266 308 aa8.21□□□□□ -1.1
GGA3-218ENST00000584243 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.21□□□□□ -1.1
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