RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579743.2

GGA3-208, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 4

Gene GGA3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-208	ENST00000579743	RFFL	Q8WZ73	363 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MCEE	Q96PE7	176 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	EPHB6	O15197	1021 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DAPK3	O43293	454 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TM7SF2	O76062	418 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MT-CO3	P00414	261 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CSF2	P04141	144 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	YPEL5	P62699	121 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ELP6	Q0PNE2	266 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PTP4A2	Q12974	167 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	BMF	Q96LC9	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	PARVA	Q9NVD7	372 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SPAST	Q9UBP0	616 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ADAMTS20	P59510	1910 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	AKAP13	Q12802	2813 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FRY	Q5TBA9	3013 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	POM121B	A6NF01	834 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CCP110	O43303	1012 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	AQP9	O43315	295 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	RNF8	O76064	485 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TMCC1	O94876	653 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	GJB6	O95452	261 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	JUND	P17535	347 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	BLK	P51451	505 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TPI1	P60174	286 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ERAP2	Q6P179	960 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ATL2	Q8NHH9	583 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FGF11	Q92914	225 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	APOLD1	Q96LR9	279 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-208	ENST00000579743	APC2	O95996	2303 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	WASH4P	A8MWX3	477 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RASA4B	C9J798	803 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743		K7ESM1	405 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	TPP1	O14773	563 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RASA4	O43374	803 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	OPA1	O60313	960 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	CD160	O95971	181 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	HTR1B	P28222	390 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	GK	P32189	559 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SERINC3	Q13530	473 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	FZD2	Q14332	565 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	FAXC	Q5TGI0	409 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-208	ENST00000579743	RNF103	O00237	685 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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