RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, human

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB40C-211	ENST00000568586	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586		J3KR12	359 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	AREL1	O15033	823 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	IGSF6	O95976	241 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	TCF4	P15884	667 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	PRLR	P16471	622 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ABL2	P42684	1182 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	RHOA	P61586	193 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	RAD51	Q06609	339 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	LZTR1	Q8N653	840 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	TEKT4	Q8WW24	435 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ASB12	Q8WXK4	309 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	NUP85	Q9BW27	656 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	TOR4A	Q9NXH8	423 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	USP24	Q9UPU5	2620 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	SPINT1	O43278	529 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	DAPK3	O43293	454 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	UGT2B4	P06133	528 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	AKT2	P31751	481 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	FGL2	Q14314	439 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	NFKBIB	Q15653	356 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	INAVA	Q3KP66	663 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	NPW	Q8N729	165 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	KLK6	Q92876	244 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ZWILCH	Q9H900	591 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		29.79	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	RARA	P10276	462 aa		29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	IL9R	Q01113	521 aa		29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	VSTM4	Q8IW00	320 aa		29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		29.78	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	SPINK2	P20155	84 aa		29.77	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	CSNK1D	P48730	415 aa		29.77	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	29.77	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	GRM3	Q14832	879 aa		29.77	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	SLC18A3	Q16572	532 aa		29.77	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	NETO2	Q8NC67	525 aa		29.77	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	GPR27	Q9NS67	375 aa		29.77	■■■□□ 2.36
RAB40C-211	ENST00000568586	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	TSPAN11	A1L157	253 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586		H3BRJ5	948 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	TNFSF14	O43557	240 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	SUOX	P51687	545 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	FAM71B	Q8TC56	605 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	TSC1	Q92574	1164 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	BTBD6	Q96KE9	485 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		29.76	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	MYO1F	O00160	1098 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	INSIG1	O15503	277 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	THEGL	P0DJG4	465 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	IL10RB	Q08334	325 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	BMF	Q96LC9	184 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	FZD3	Q9NPG1	666 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		29.75	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	IGF2R	P11717	2491 aa		29.74	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	ITGAV	P06756	1048 aa		29.74	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	TIMP2	P16035	220 aa		29.74	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	ARL4A	P40617	200 aa		29.74	■■■□□ 2.35
RAB40C-211	ENST00000568586	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	29.74	■■■□□ 2.35

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