RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF805Q5CZA5 627 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 NEK5Q6P3R8 708 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBFAQ8N0V3 343 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR4C6Q8NH72 309 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 BAP1Q92560 729 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 NTAN1Q96AB6 310 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 FEM1CQ96JP0 617 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCAPGQ9BPX3 1015 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAGEH1Q9H213 219 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRPM6Q9BX84 2022 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATRXP46100 2492 aa7.27□□□□□ -1.24
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYLKQ15746 1914 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPED1A4D0V7 1026 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC53A6NM62 1247 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIGLEC16A6NMB1 481 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KDELR3O43731 214 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 AP1G1O43747 822 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRINP1O60477 761 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MMP20O60882 483 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 POP4O95707 220 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRKCGP05129 697 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1SP09871 688 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALPPL2P10696 532 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FERP16591 822 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSMA2P25787 234 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGFALSP35858 605 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABCG1P45844 678 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GSCP56915 257 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TPI1P60174 286 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1orf61Q13536 156 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDKN3Q16667 212 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CA9Q16790 459 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYLK3Q32MK0 819 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDPD4Q6W3E5 623 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC7BQ86TV6 843 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PARGQ86W56 976 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 MCOLN2Q8IZK6 566 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAF1Q8N7H5 531 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LMX1AQ8TE12 382 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 VOPP1Q96AW1 172 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 BMFQ96LC9 184 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOLD1Q96LR9 279 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ERGIC2Q96RQ1 377 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 EPAS1Q99814 870 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNPY3Q9BT09 278 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM7Q9C029 511 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM51Q9NW97 253 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLGN3Q9NZ94 848 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LHX3Q9UBR4 397 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 DKK4Q9UBT3 224 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLF15Q9UIH9 416 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 FZD10Q9ULW2 581 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPEGQ15772 3267 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 H3BM21 787 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-212ENST00000567690 J3KR12 359 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms