RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 FADS3Q9Y5Q0 445 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.35■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZZEF1O43149 2961 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 C16orf96A6NNT2 1141 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF103O00237 685 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 WNT9AO14904 365 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 UGT2B4P06133 528 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 H2AFZP0C0S5 128 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL1R2P27930 398 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUOXP51687 545 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 HADHQ16836 314 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 H2AFVQ71UI9 128 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNGA4Q8IV77 575 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR6K2Q8NGY2 324 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 HCAR2Q8TDS4 363 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC39A8Q9C0K1 460 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABHD10Q9NUJ1 306 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 DKK3Q9UBP4 350 aa17.34■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM131Q92545 1883 aa17.33■□□□□ 0.37
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 MFAP3LO75121 409 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 RARAP10276 462 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 RXRGP48443 463 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSNK1DP48730 415 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL10RBQ08334 325 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMCO4Q5TGY1 634 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SARM1Q6SZW1 724 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLNQ7Z5Q5 900 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 RHBDD1Q8TEB9 315 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASB12Q8WXK4 309 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSPH1Q92598 858 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 VOPP1Q96AW1 172 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL32Q96NJ5 620 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF599Q96NL3 588 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAMK1GQ96NX5 476 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SP110Q9HB58 689 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHX3Q9UBR4 397 aa17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 J3KR12 359 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEMP1O14524 444 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC31A1O15431 190 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 AKR1B10O60218 316 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROS1P07225 676 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 GKP32189 559 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERPINB6P35237 376 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM193AP78312 1265 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXC1Q12948 553 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYTH1Q15438 398 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMTNL2Q2TAL5 461 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMCO3Q6UWJ1 677 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPWQ8N729 165 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSPG4P5Q96PW8 444 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC17A9Q9BYT1 436 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 WASF3Q9UPY6 502 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa17.32■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 DFFAO00273 331 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNK3O14649 394 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 AREL1O15033 823 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 PALMO75781 387 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 PROSCO94903 275 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM253P0C7T8 217 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCF4P15884 667 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRLRP16471 622 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGCGQ13326 291 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEL1L3Q68CR1 1132 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC49Q8IUZ0 686 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 DENND6BQ8NEG7 585 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM71BQ8TC56 605 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTBD6Q96KE9 485 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC42Q96M95 316 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDH18Q9HCL0 1135 aa17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPAN11A1L157 253 aa17.3■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 A6NNZ2 444 aa17.3■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 THEGLP0DJG4 465 aa17.3■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAN1A1P33908 653 aa17.3■□□□□ 0.36
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABL2P42684 1182 aa17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms