RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561726.1

TNRC6A-208, Transcript of trinucleotide repeat containing 6A, humanhuman

TSL 4

Gene TNRC6A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6A-208ENST00000561726 O00370 1275 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CTDSP2O14595 271 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CA12O43570 354 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 VEGFDO43915 354 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TULP3O75386 442 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SEC14L2O76054 403 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLITRK3O94933 977 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 STAMBPO95630 424 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ASGR1P07306 291 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TUBBP07437 444 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 KRT5P13647 590 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 PDGFRAP16234 1089 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 AVPR2P30518 371 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 MAGEA4P43358 317 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC6A9P48067 706 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 PIK3CGP48736 1102 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CENPAP49450 140 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 BMXP51813 675 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TUBB4BP68371 445 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TAP1Q03518 808 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ELP6Q0PNE2 266 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CRY2Q49AN0 593 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CCDC122Q5T0U0 273 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 METRNLQ641Q3 311 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CENPPQ6IPU0 288 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 PLXDC1Q8IUK5 500 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 LCORLQ8N3X6 602 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SFRP1Q8N474 314 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SUPT20HQ8NEM7 779 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 REPS2Q8NFH8 660 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 GPR156Q8NFN8 814 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 OR52K1Q8NGK4 314 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SUN5Q8TC36 379 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 AGR3Q8TD06 166 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 WASF1Q92558 559 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CORO2AQ92828 525 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SPSB4Q96A44 273 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SAAL1Q96ER3 474 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 MED15Q96RN5 788 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 NEU1Q99519 415 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ADAM2Q99965 735 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 LZTS2Q9BRK4 669 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 NACAP1Q9BZK3 213 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 MTMR12Q9C0I1 747 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TAOK3Q9H2K8 898 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC32A1Q9H598 525 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 VCPKMTQ9H867 229 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 MAGEE1Q9HCI5 957 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 TRPV5Q9NQA5 729 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 GLRX2Q9NS18 164 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 INTS13Q9NVM9 706 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 KCND2Q9NZV8 630 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 GDAQ9Y2T3 454 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 KDRP35968 1356 aa3.54□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa3.54□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 RPTORQ8N122 1335 aa3.54□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 A0A087WWL8 130 aa3.54□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.54□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TNRC6A-208ENST00000561726 ZAR1LA6NP61 321 aa3.54□□□□□ -1.84
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