RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555653.1

MIS18BP1-211, Transcript of MIS18 binding protein 1, human

TSL 2

Gene MIS18BP1, Length 429 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZBED4	O75132	1171 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ARL3	P36405	182 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PTPN9	P43378	593 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DCAF7	P61962	342 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CCNG2	Q16589	344 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ME3	Q16798	604 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NRAC	Q8N912	160 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	METTL6	Q8TCB7	284 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RNF183	Q96D59	192 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KRT84	Q9NSB2	600 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	C20orf141	Q9NUB4	165 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NLK	Q9UBE8	527 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653		A0A1W2PQM1	296 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TAF4	O00268	1085 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MDM4	O15151	490 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MTA2	O94776	668 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	IFNA2	P01563	188 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HEXA	P06865	529 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KCNJ4	P48050	445 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SLC18A2	Q05940	514 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MTX1	Q13505	466 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	KRT32	Q14532	448 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SLC46A3	Q7Z3Q1	461 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PLD5	Q8N7P1	536 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	EME1	Q96AY2	570 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653		A0A0A0MQY5	61 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653		A0A0G2JK05	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TACC1	O75410	805 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ACADM	P11310	421 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CTPS1	P17812	591 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	CD72	P21854	359 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TNFSF8	P32971	234 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	ME1	P48163	572 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	POLD2	P49005	469 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RASSF2	P50749	326 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	PKP1	Q13835	747 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	RUNX2	Q13950	521 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MIS18BP1-211	ENST00000555653	TWIST1	Q15672	202 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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