RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554574.1

PPP4R3A-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, human

TSL 2

Gene PPP4R3A, Length 1,944 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TOM1L1	O75674	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	LGALS2	P05162	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PYGL	P06737	847 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PRLR	P16471	622 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	INHBE	P58166	350 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	DRP2	Q13474	957 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TFDP1	Q14186	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PSMD6	Q15008	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	FAM81B	Q96LP2	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TBATA	Q96M53	351 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	RAB27B	O00194	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	CLDN3	O15551	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	FAM189A1	O60320	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PRSS23	O95084	383 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	C22orf31	O95567	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	KRT1	P04264	644 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	EDN1	P05305	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ITGB1	P05556	798 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	HOXC6	P09630	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	FDXR	P22570	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ACVR2A	P27037	513 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	COPA	P53621	1224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MFAP3	P55082	362 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ARL4C	P56559	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MXRA7	P84157	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	GCNT1	Q02742	428 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TCF15	Q12870	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MAPK6	Q16659	721 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	SHC3	Q92529	594 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP4R3A-204	ENST00000554574	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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