RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	HESX1	Q9UBX0	185 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		6.63	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SLC12A8	A0AV02	714 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	LNP1	A1A4G5	178 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	BICDL2	A1A5D9	508 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	CCDC188	H7C350	402 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KRIT1	O00522	736 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	E2F6	O75461	281 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	DPP6	P42658	865 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF132	P52740	706 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	PMS2	P54278	862 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	MFAP3	P55082	362 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	DAOA	P59103	153 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	PHEX	P78562	749 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ADIG	Q0VDE8	80 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SLC29A2	Q14542	456 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	RPS6KA1	Q15418	735 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	STIL	Q15468	1287 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	LIN52	Q52LA3	116 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	RINL	Q6ZS11	566 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	FRMD1	Q8N878	549 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ARL10	Q8N8L6	244 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	MGARP	Q8TDB4	240 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	TFAP2B	Q92481	460 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	INPP5D	Q92835	1189 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	EDEM2	Q9BV94	578 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	PLK2	Q9NYY3	685 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	HAO1	Q9UJM8	370 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0J9YVX5	310 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	NPC1	O15118	1278 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ATP5H	O75947	161 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	LATS1	O95835	1130 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	LYN	P07948	512 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	HMBS	P08397	361 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	CD19	P15391	556 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	NDUFV2	P19404	249 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	HOXD12	P35452	270 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	WAS	P42768	502 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SLCO1A2	P46721	670 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	GCNT1	Q02742	428 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SULT2A1	Q06520	285 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KCNMA1	Q12791	1236 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM270	Q6UE05	265 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	DENND1C	Q8IV53	801 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	UBA3	Q8TBC4	463 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	KAT5	Q92993	513 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FGD4-215	ENST00000551984	SPTBN2	O15020	2390 aa		6.62	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms