RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551009.5

ATP2B1-208, Transcript of ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1, human

TSL 3

Gene ATP2B1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2B1-208	ENST00000551009	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	AASS	Q9UDR5	926 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009		H0Y3Z8	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	HMMR	O75330	724 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	FAM155B	O75949	473 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	POLB	P06746	335 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TNFSF8	P32971	234 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZP1	P60852	638 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	VAMP2	P63027	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	EGR4	Q05215	589 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TAF5	Q15542	800 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ASIC2	Q16515	512 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	MEA1	Q16626	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUSP6	Q16828	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	MEIS3	Q99687	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009		E7EVH7	732 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	P4HA2	O15460	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SPRY3	O43610	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TMCC1	O94876	653 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CYP1A2	P05177	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CPA1	P15085	419 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CHRNB2	P17787	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ALOX12	P18054	663 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CNTF	P26441	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TYK2	P29597	1187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ENTPD1	P49961	510 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SNX16	P57768	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SELENOV	P59797	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TRPC3	Q13507	836 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	PKP1	Q13835	747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	GXYLT1	Q4G148	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009		Q6ZTC4	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	LCA5	Q86VQ0	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	CLGN	O14967	610 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATP2B1-208	ENST00000551009	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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