RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

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Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 SPACA7Q96KW9 195 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.58□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 CCDC159P0C7I6 412 aa8.57□□□□□ -1.04
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PTPRB-208ENST00000550358 CD86P42081 329 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 CACNG1Q06432 222 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 AAGABQ6PD74 315 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF605Q86T29 641 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.57□□□□□ -1.04
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