RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.14
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	CAPN14	A8MX76	684 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	GEM	P55040	296 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PANX3	Q96QZ0	392 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	MKS1	Q9NXB0	559 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	SOX13	Q9UN79	622 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ASB3	Q9Y575	518 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	CSF2RA	P15509	400 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	DNAJB2	P25686	324 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	RENBP	P51606	427 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ARHGAP8	P85298	464 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	MTA1	Q13330	715 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	NACA2	Q9H009	215 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		15.89	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	AHCYL1	O43865	530 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	GJB5	O95377	273 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TACR2	P21452	398 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	POLE2	P56282	527 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TPGS2	Q68CL5	300 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	FATE1	Q969F0	183 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PSMG2	Q969U7	264 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	CPNE1	Q99829	537 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	FICD	Q9BVA6	458 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	RAMP2	O60895	175 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PMPCB	O75439	489 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ITGA2B	P08514	1039 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	OR1E1	P30953	314 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ADRA1A	P35348	466 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	GP5	P40197	560 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	HECTD3	Q5T447	861 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	MARC1	Q5VT66	337 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF778	Q96MU6	729 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	KIFC1	Q9BW19	673 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	SP110	Q9HB58	689 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		15.88	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	COCH	O43405	550 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TIMP1	P01033	207 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ANPEP	P15144	967 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	NMBR	P28336	390 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	CRHR1	P34998	444 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ALDH1A3	P47895	512 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	GJA8	P48165	433 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	AGAP2	Q99490	1192 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	NT5M	Q9NPB1	228 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193		F5H5T6	163 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	KLF11	O14901	512 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	RAP1GDS1	P52306	607 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	PARP15	Q460N3	678 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	GRTP1	Q5TC63	336 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	LGI2	Q8N0V4	545 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	15.87	■□□□□ 0.13
GRSF1-208	ENST00000545193	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		15.87	■□□□□ 0.13

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