RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	FLCN	Q8NFG4	579 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	FRS2	Q8WU20	508 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EDA	Q92838	391 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ACOX2	Q99424	681 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ERP44	Q9BS26	406 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	DPH5	Q9H2P9	285 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM245	Q9H330	911 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ETNK1	Q9HBU6	452 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	DYRK4	Q9NR20	520 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	VPS45	Q9NRW7	570 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	UBP1	Q9NZI7	540 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	IL36A	Q9UHA7	158 aa		12.04	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MUSK	O15146	869 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SIN3B	O75182	1162 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PMPCB	O75439	489 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	METTL18	O95568	372 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	APRT	P07741	180 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CHRNB1	P11230	501 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	NFKBIA	P25963	317 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	RGR	P47804	291 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	EPHB1	P54762	984 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	GUCY2D	Q02846	1103 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	SLC14A2	Q15849	920 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MYLK3	Q32MK0	819 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	IPMK	Q8NFU5	416 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PJA1	Q8NG27	643 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	PTPRN2	Q92932	1015 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658	MYLK	Q15746	1914 aa		12.03	□□□□□ -0.48
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PQ67	120 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SMAP	O00193	183 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SOCS5	O75159	536 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PIGN	O95427	931 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	IL1B	P01584	269 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	UGT2B4	P06133	528 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CR2	P20023	1033 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MAGEA9	P43362	315 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SKOR1	P84550	965 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CAV1	Q03135	178 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SEMA5A	Q13591	1074 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ENPP2	Q13822	863 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00523	Q86TU6	105 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	IFT20	Q8IY31	132 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	STK40	Q8N2I9	435 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	OR2T3	Q8NH03	318 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	GABRG3	Q99928	467 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	FICD	Q9BVA6	458 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NOD2	Q9HC29	1040 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	WHRN	Q9P202	907 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SNX24	Q9Y343	169 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		12.02	□□□□□ -0.49
DDB1-223	ENST00000543658	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		12.02	□□□□□ -0.49

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