RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543470.5

RPS6KC1-207, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-207ENST00000543470 MZB1Q8WU39 189 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CPA4Q9UI42 421 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MYRFQ9Y2G1 1151 aa14.61□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 KLHL33A6NCF5 533 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ITGAXP20702 1163 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PIK3R1P27986 724 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CRABP2P29373 138 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 LRPAP1P30533 357 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 GRIA3P42263 894 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 GPD2P43304 727 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 GALK1P51570 392 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCDC142Q17RM4 750 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZFAND2BQ8WV99 257 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZFYVE19Q96K21 471 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 NPAS2Q99743 824 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ALG9Q9H6U8 611 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 USP29Q9HBJ7 922 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 VPS45Q9NRW7 570 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 GPR25O00155 361 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MSCO60682 206 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MAFO75444 373 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCDC166P0CW27 439 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CTBP1Q13363 440 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PFKFB4Q16877 469 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TMEM245Q9H330 911 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PRR23AA6NEV1 266 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CILPO75339 1184 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CRTAMO95727 393 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 BCL10O95999 233 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 EGFRP00533 1210 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PIRTP0C851 137 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.075e-6■□□□□ 8.4
RPS6KC1-207ENST00000543470 HALP42357 657 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 NPY2RP49146 381 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC16A1P53985 500 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SNX17Q15036 470 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 WSCD1Q658N2 575 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 WNT8BQ93098 351 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 OR52B2Q96RD2 323 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PREBQ9HCU5 417 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.6□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZNF839A8K0R7 811 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 A8MX80 341 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 RHOAP61586 193 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SIGLEC10Q96LC7 697 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRHDEQ9UKU6 1024 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CNTNAP1P78357 1384 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 LAMB2P55268 1798 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 NFASCO94856 1347 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 KRT75O95678 551 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CHRNGP07510 517 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 NFKB1P19838 968 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 WEE1P30291 646 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCT8P50990 548 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CDH13P55290 713 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DGCR6Q14129 220 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 BDH2Q9BUT1 245 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DGCR6LQ9BY27 220 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 DPY30Q9C005 99 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PSMD13Q9UNM6 376 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 BTN3A1O00481 513 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 ERCC2P18074 760 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 PTPRAP18433 802 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 BFSP2Q13515 415 aa14.59□□□□□ -0.07
RPS6KC1-207ENST00000543470 CCNIQ14094 377 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms