RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540606.5

ATE1-208, Transcript of arginyltransferase 1, human

TSL 2 BASIC

Gene ATE1, Length 5,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATE1-208	ENST00000540606	GSAP	A4D1B5	854 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	OR6C75	A6NL08	312 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	EPN2	O95208	641 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CLPTM1	O96005	669 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	HPCAL1	P37235	193 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	P2RY11	Q96G91	374 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GDF3	Q9NR23	364 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		13.38	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	OR6A2	O95222	327 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	LRPAP1	P30533	357 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	NEK3	P51956	506 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PRKAA2	P54646	552 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PGM2	Q96G03	612 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CPXM1	Q96SM3	734 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606		A0A087X1B8	175 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RTP1	P59025	263 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ALLC	Q8N6M5	410 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27	6e-6	■■□□□ 13.9
ATE1-208	ENST00000540606	SELP	P16109	830 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ALG3	Q92685	438 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	BTBD9	Q96Q07	612 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	KLHL1	Q9NR64	748 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RAB21	Q9UL25	225 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ZNF839	A8K0R7	811 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	C1R	P00736	705 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ELFN1	P0C7U0	828 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GMIP	Q9P107	970 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	DEC1	Q9P2X7	70 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CARNS1	A5YM72	827 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CCL16	O15467	120 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	FAM20B	O75063	409 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GUCY1B2	O75343	617 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	UGT2B4	P06133	528 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	NTS	P30990	170 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ADRA1B	P35368	520 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	TRIM16L	Q309B1	348 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ERBB2	P04626	1255 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	COPZ1	P61923	177 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	XKR6	Q5GH73	641 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	PIPSL	A2A3N6	862 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SOX6	P35712	828 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	GRIA4	P48058	902 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	MAPK10	P53779	464 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	FUT2	Q10981	343 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ATE1-208	ENST00000540606	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27

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