RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GRIA1P42261 906 aa23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 METAP1P53582 386 aa23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.275e-7■■■■■ 30.3
TSNARE1-208ENST00000524325 GAS6Q14393 721 aa23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 NCEH1Q6PIU2 408 aa23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CPT1BQ92523 772 aa23.01■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 COL9A1P20849 921 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ARSIQ5FYB1 569 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 IZUMO3Q5VZ72 239 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ALG1LQ6GMV1 187 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PWWP2AQ96N64 755 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC6A17Q9H1V8 727 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TTC28Q96AY4 2481 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 E7EVH7 732 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TP73O15350 636 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 DCNP07585 359 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 VASPP50552 380 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ENPP2Q13822 863 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SMIM14Q96QK8 99 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SARDHQ9UL12 918 aa23■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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TSNARE1-208ENST00000524325 AGTP01019 485 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 LMAN1P49257 510 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 WNT3AP56704 352 aa22.99■■□□□ 1.27
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TSNARE1-208ENST00000524325 PTPRRQ15256 657 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 KDM1BQ8NB78 822 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 IFT81Q8WYA0 676 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM129BQ96TA1 746 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 GRHL1Q9NZI5 618 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CHKBQ9Y259 395 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.99■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1W2PQF6 199 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 LEFTY1O75610 366 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM63AO94886 807 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT2B4P06133 528 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PDHA1P08559 390 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPINF2P08697 491 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXB2P14652 356 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNA4P43681 627 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGA8P53708 1063 aa22.98■■□□□ 1.27
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TSNARE1-208ENST00000524325 SEMA5AQ13591 1074 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PRPSAP1Q14558 356 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO43Q4G163 708 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 KDELC1Q6UW63 502 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM67Q6ZTA4 783 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 UBXN4Q92575 508 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 EDAQ92838 391 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MRGPRX2Q96LB1 330 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 RAB17Q9H0T7 212 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 BDP1A6H8Y1 2624 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 DCXO43602 365 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 FDFT1P37268 417 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SDE2Q6IQ49 451 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TADA1Q96BN2 335 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC45Q96CN5 670 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SNF8Q96H20 258 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 FICDQ9BVA6 458 aa22.98■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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TSNARE1-208ENST00000524325 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNJ11Q14654 390 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 KCTD11Q693B1 232 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC70Q6NSX1 233 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PJA1Q8NG27 643 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CCHCR1Q8TD31 782 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 GABRG3Q99928 467 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MFSD1Q9H3U5 465 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 SUN2Q9UH99 717 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 IL36AQ9UHA7 158 aa22.97■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PI15O43692 258 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PRKCGP05129 697 aa22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TSNARE1-208ENST00000524325 PLTPP55058 493 aa22.96■■□□□ 1.27
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