RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 SGCZQ96LD1 299 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 IMPG2Q9BZV3 1241 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D13Q9NVG8 400 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GDE1Q9NZC3 331 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EHD2Q9NZN4 543 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ADAM28Q9UKQ2 775 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP12Q9UNI6 340 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 HS3ST4Q9Y661 456 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 COL4A3Q01955 1670 aa4.53□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 A0A087WWL8 130 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ARL5CA6NH57 179 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 LRRIQ4A6NIV6 560 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ISM1B1AKI9 464 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RASA4BC9J798 803 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 K7ERI5 159 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DCLK1O15075 740 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RASA4O43374 803 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TADA2AO75478 443 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SLITRK3O94933 977 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TDP2O95551 362 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MCF2P10911 925 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.692e-11■■□□□ 14.1
HDAC2-216ENST00000523628 ELF1P32519 619 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CA8P35219 290 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ARL2P36404 184 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PDE6CP51160 858 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CLCN4P51793 760 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 AK2P54819 239 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 UCP3P55916 312 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RPS16P62249 146 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MC2RQ01718 297 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 BIRC2Q13490 618 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CAMK1Q14012 370 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PTPN14Q15678 1187 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF528Q3MIS6 628 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 LIX1LQ8IVB5 337 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RHOT2Q8IXI1 618 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP52Q8N1V2 620 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 FITM2Q8N6M3 262 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DNASE1L2Q92874 299 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SCAMP4Q969E2 229 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 NACC2Q96BF6 587 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CALML4Q96GE6 196 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PGBD1Q96JS3 809 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TCEANC2Q96MN5 208 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MTMR9Q96QG7 549 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 S1PR5Q9H228 398 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SMOC2Q9H3U7 446 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 FZD8Q9H461 694 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TRPV5Q9NQA5 729 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RLIMQ9NVW2 624 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP97Q9P2B7 532 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 DERAQ9Y315 318 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ASB3Q9Y575 518 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 H3BQV1 296 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 SLC37A4O43826 429 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 MGEA5O60502 916 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TSPAN1O60635 241 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TOM1L1O75674 476 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 GLP2RO95838 553 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PRKCBP05771 671 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 BRAFP15056 766 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 CYP3A5P20815 502 aa4.51□□□□□ -1.69
HDAC2-216ENST00000523628 TNFSF4P23510 183 aa4.51□□□□□ -1.69
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