RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-208ENST00000515588 MAN1A1P33908 653 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 GJC1P36383 396 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 SLC14A1Q13336 389 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 DPYSL3Q14195 570 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 KRT81Q14533 505 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 MESDQ14696 234 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 HADHQ16836 314 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM259Q4ZIN3 620 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 FBXL19Q6PCT2 694 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TMCO3Q6UWJ1 677 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 KLHL11Q9NVR0 708 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 GGT7Q9UJ14 662 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 DMTF1Q9Y222 760 aa15.96■□□□□ 0.15
SERF1B-208ENST00000515588 H0Y8X5 98 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 MUSKO15146 869 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SLC31A1O15431 190 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 AP1G1O43747 822 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SH3BP5O60239 455 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 PALMO75781 387 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 PIGNO95427 931 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 PEX11BO96011 259 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ADRB1P08588 477 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF883P0CG24 379 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 CEACAM1P13688 526 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 NUDT1P36639 197 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 C21orf59P57076 290 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 FAM193AP78312 1265 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 IL10RBQ08334 325 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 FGL2Q14314 439 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 LRRC73Q5JTD7 316 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RFFLQ8WZ73 363 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 NSMCE3Q96MG7 304 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SP110Q9HB58 689 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ITM2BQ9Y287 266 aa15.95■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TLR4O00206 839 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 AREL1O15033 823 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TIMP2P16035 220 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ITIH2P19823 946 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RAD51Q06609 339 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TCEAL1Q15170 157 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 MFSD2AQ8NA29 543 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 KCTD6Q8NC69 237 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RAPGEF5Q92565 580 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RAB7BQ96AH8 199 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 MYOCQ99972 504 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 CALN1Q9BXU9 219 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 FZD3Q9NPG1 666 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 DKK3Q9UBP4 350 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 LCMT1Q9UIC8 334 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 INTUQ9ULD6 942 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TMEM131Q92545 1883 aa15.94■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 MAFKO60675 156 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 LCA5LO95447 670 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 KRT7P08729 469 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ARHGAP25P42331 645 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 CSNK1DP48730 415 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 NXPH1P58417 271 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RPS21P63220 83 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SHBQ15464 509 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SRLQ86TD4 932 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TTC7BQ86TV6 843 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ZSWIM9Q86XI8 627 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 NAXDQ8IW45 347 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RHOT2Q8IXI1 618 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 FAF2Q96CS3 445 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 FEM1CQ96JP0 617 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF599Q96NL3 588 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 ZNF670Q9BS34 389 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SLC32A1Q9H598 525 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TFR2Q9UP52 801 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TRPM6Q9BX84 2022 aa15.93■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 A0A1B0GTQ1 180 aa15.92■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.92■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TSPAN11A1L157 253 aa15.92■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 IGLON5A6NGN9 336 aa15.92■□□□□ 0.14
SERF1B-208ENST00000515588 RAD51BO15315 384 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms