RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 GIPC1O14908 333 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 MCF2LO15068 1137 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SNAP91O60641 907 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 GBE1Q04446 702 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 FOXJ1Q92949 421 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 FATE1Q969F0 183 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SLC6A17Q9H1V8 727 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SLC32A1Q9H598 525 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.48■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ATP9BO43861 1147 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ZMPSTE24O75844 475 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SERPINF2P08697 491 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 PAFAH1B1P43034 410 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 RAD51Q06609 339 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 LLGL1Q15334 1064 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 MARC1Q5VT66 337 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 CCDC13Q8IYE1 715 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 HDDC3Q8N4P3 179 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 AMACRQ9UHK6 382 aa20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 CKAP5Q14008 2032 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 H7C0C1 242 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 MATN3O15232 486 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 FGGP02679 453 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 EPHX1P07099 455 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 CXCR5P32302 372 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 IL12RB1P42701 662 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ATP5OP48047 213 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ARF5P84085 180 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 AP1B1Q10567 949 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 ENPP2Q13822 863 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 NOMO1Q15155 1222 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 DLG2Q15700 870 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 DEFB124Q8NES8 71 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 WDR24Q96S15 920 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 TMEM245Q9H330 911 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 SEPT3Q9UH03 358 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa20.46■□□□□ 0.87
USP53-208ENST00000514305 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 MAFKO60675 156 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 SYPP08247 313 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 SRCP12931 536 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 GNSP15586 552 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 CD6P30203 668 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 FOXC1Q12948 553 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 ZNF235Q14590 738 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 LBRQ14739 615 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 PTPRNQ16849 979 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 ACTL9Q8TC94 416 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 OLFM3Q96PB7 478 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 CAPN10Q9HC96 672 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 CD93Q9NPY3 652 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 PCDH15Q96QU1 1955 aa20.45■□□□□ 0.86
USP53-208ENST00000514305 J3KR12 359 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms