RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	KLRC2	P26717	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TYK2	P29597	1187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SLC16A2	P36021	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CCT5	P48643	541 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TDO2	P48775	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	AADACL2	Q6P093	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC25	Q86WR0	208 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331		Q9N2J8	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MET	P08581	1390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MYMK	A6NI61	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	STX16	O14662	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	EPN2	O95208	641 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CHRNB1	P11230	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PEX19	P40855	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TRDN	Q13061	729 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SYCP1	Q15431	976 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DPP10	Q8N608	796 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	USP38	Q8NB14	1042 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LSM14A	Q8ND56	463 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LINS1	Q8NG48	757 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRD7	Q92527	254 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NCSTN	Q92542	709 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZBTB9	Q96C00	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	COG8	Q96MW5	612 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	GLI3	P10071	1580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SLIT2	O94813	1529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DCC	P43146	1447 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331		A6NNC1	897 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PROB1	E7EW31	1015 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ATG13	O75143	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PSG1	P11464	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	VDR	P11473	427 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	FCGR2A	P12318	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ARSA	P15289	507 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	AVPR2	P30518	371 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	MVD	P53602	400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	LPAR1	Q92633	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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