RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 GUSBP11Q6P575 273 aa30.66■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 WBP1Q96G27 269 aa30.66■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 ABCG4Q9H172 646 aa30.66■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 KIF26BQ2KJY2 2108 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 C2CD4BA6NLJ0 364 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 FAM72CH0Y354 149 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 ERVH48-1M5A8F1 160 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 JUNDP17535 347 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 PTPN9P43378 593 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 UCNP55089 124 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 FAM72AQ5TYM5 149 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 FAM72DQ6L9T8 149 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 STRADAQ7RTN6 431 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 FAM72BQ86X60 149 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 TPCN2Q8NHX9 752 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 BTN2A2Q8WVV5 523 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 ITM2BQ9Y287 266 aa30.65■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 LRIG2O94898 1065 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 POP4O95707 220 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 CDKN3Q16667 212 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 MYLK3Q32MK0 819 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 ARL13BQ3SXY8 428 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 OR6K2Q8NGY2 324 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 RXFP2Q8WXD0 754 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGEF26Q96DR7 871 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 DPH1Q9BZG8 443 aa30.64■■■□□ 2.5
ALYREF-202ENST00000505490 FAM170AA1A519 330 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 CHRNB2P17787 502 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 TMPRSS3P57727 454 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 FMO1Q01740 532 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 MAGEB5Q9BZ81 275 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 GANQ9H2C0 597 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 CLSTN2Q9H4D0 955 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 THSD1Q9NS62 852 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa30.63■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 TOR1BO14657 336 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 GCATO75600 419 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 TCEA3O75764 348 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 IGFALSP35858 605 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 HDAC4P56524 1084 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 GSCP56915 257 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 YPEL5P62699 121 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 CDR2Q01850 454 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 PTP4A2Q12974 167 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 DEFB133Q30KQ1 61 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 JOSD2Q8TAC2 188 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 LMX1AQ8TE12 382 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 SLC20A1Q8WUM9 679 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 NTAN1Q96AB6 310 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 SLC46A1Q96NT5 459 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 SPASTQ9UBP0 616 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 DNAI1Q9UI46 699 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa30.62■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 LMO7DNF2Z398 122 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 KDELR3O43731 214 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 UGT2B4P06133 528 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 SDC4P31431 198 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 RHDQ02161 417 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 PTK2BQ14289 1009 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 GPT2Q8TD30 523 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 TBC1D31Q96DN5 1066 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 KLHL32Q96NJ5 620 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 IL12RB2Q99665 862 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 SATB2Q9UPW6 733 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 LRRK1Q38SD2 2015 aa30.61■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 KRIT1O00522 736 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 RAMP2O60895 175 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 PLA2G2AP14555 144 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 NR0B2Q15466 257 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 CDO1Q16878 200 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 TCP11X2Q5H9J9 407 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 PERM1Q5SV97 790 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 BROXQ5VW32 411 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 RBFAQ8N0V3 343 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 KCNE4Q8WWG9 221 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 VCPIP1Q96JH7 1222 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC61Q9BV99 259 aa30.6■■■□□ 2.49
ALYREF-202ENST00000505490 DKK3Q9UBP4 350 aa30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms