RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 ZHX3Q9H4I2 956 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-215ENST00000498284 MVB12BQ9H7P6 319 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-215ENST00000498284 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-215ENST00000498284 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-215ENST00000498284 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-215ENST00000498284 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRK-215ENST00000498284 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.66□□□□□ -1.66
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PTPRK-215ENST00000498284 RFX2P48378 723 aa4.65□□□□□ -1.67
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PTPRK-215ENST00000498284 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
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PTPRK-215ENST00000498284 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.64□□□□□ -1.67
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PTPRK-215ENST00000498284 RUNX2Q13950 521 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF284Q2VY69 593 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-215ENST00000498284 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRK-215ENST00000498284 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
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PTPRK-215ENST00000498284 ZNF549Q6P9A3 640 aa4.63□□□□□ -1.67
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