RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	SCNN1B	P51168	640 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	AP1S1	P61966	158 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	GRM2	Q14416	872 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PCSK7	Q16549	785 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	SRL	Q86TD4	932 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	MYLIP	Q8WY64	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	IFT43	Q96FT9	208 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	NOD2	Q9HC29	1040 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	DEC1	Q9P2X7	70 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	TIMM44	O43615	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	OPA1	O60313	960 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	GSR	P00390	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	FGF1	P05230	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	IVL	P07476	585 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PGAM1	P18669	254 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	HLA-DPA1	P20036	260 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	KCNA5	P22460	613 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	GJA4	P35212	333 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	NNMT	P40261	264 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	CTSO	P43234	321 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	GPX6	P59796	221 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	SNRPD1	P62314	119 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	CDK18	Q07002	472 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	MTM1	Q13496	603 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	OLIG2	Q13516	323 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	IHH	Q14623	411 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	STAT4	Q14765	748 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	GEN1	Q17RS7	908 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	STEAP4	Q687X5	459 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	C12orf40	Q86WS4	652 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PLPP6	Q8IY26	295 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	MPP5	Q8N3R9	675 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	NXPE3	Q969Y0	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	APOL2	Q9BQE5	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	MED4	Q9NPJ6	270 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	SYBU	Q9NX95	663 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		11.15	□□□□□ -0.62
PKP4-215	ENST00000494945	PLXNA2	O75051	1894 aa		11.15	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945		K7ERQ8	282 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	AGPS	O00116	658 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	ARNTL	O00327	626 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	ATP9B	O43861	1147 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	GJB3	O75712	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	TCEA3	O75764	348 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	NDST3	O95803	873 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	SHBG	P04278	402 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	POLB	P06746	335 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	ALAD	P13716	330 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	FOSL2	P15408	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	SSTR1	P30872	391 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	STX2	P32856	288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
PKP4-215	ENST00000494945	OPRD1	P41143	372 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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