RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PLOD2	O00469	737 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC28A2	O43868	658 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC4A1	P02730	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	HOXB2	P14652	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TSHR	P16473	764 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GABRB3	P28472	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	HSD17B2	P37059	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GAD2	Q05329	585 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	BNIP1	Q12981	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PGM5	Q15124	567 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PPP1R7	Q15435	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CDKL2	Q92772	493 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	COG8	Q96MW5	612 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GPR78	Q96P69	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	VCPKMT	Q9H867	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NDC80	O14777	642 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NPC1	O15118	1278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TSPAN1	O60635	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NBN	O60934	754 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NDST3	O95803	873 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CHRNB1	P11230	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ELF1	P32519	619 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RAD52	P43351	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	HTR3A	P46098	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ASMT	P46597	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RXRG	P48443	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PRIM2	P49643	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	BLVRA	P53004	296 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CSHL1	Q14406	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NEDD9	Q14511	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	EME1	Q96AY2	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MEIS3	Q99687	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RGL1	Q9NZL6	768 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SELENON	Q9NZV5	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRC72	A6NJI9	287 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TSPY2	A6NKD2	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672		A6NNC1	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672		H0YGN5	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672		M0QZQ0	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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