RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SERINC2Q96SA4 455 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SCNM1Q9BWG6 230 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS3K7RE56 304 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CSH1P0DML2 217 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CSH2P0DML3 217 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 EFNA5P52803 228 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 NLRP5P59047 1200 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SLC18A2Q05940 514 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 NIPAL4Q0D2K0 466 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KLF10Q13118 480 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RUNX2Q13950 521 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL35Q6PF15 583 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SERPINA11Q86U17 422 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CALML4Q96GE6 196 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 FEM1CQ96JP0 617 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CMTM3Q96MX0 182 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ASAH2Q9NR71 780 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ANKEF1Q9NU02 776 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MKLN1Q9UL63 735 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 FAM96BQ9Y3D0 163 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP14A8MT82 685 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 LIASO43766 372 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 STARD3NLO95772 234 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TFP02787 698 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 UNGP13051 313 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RARGP13631 454 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CDAP32320 146 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 HADHAP40939 763 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TGFB2P61812 414 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 EPS8Q12929 822 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MIDNQ504T8 468 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MFSD4BQ5TF39 518 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KDELC2Q7Z4H8 507 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM74Q86UV6 250 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM73Q86UV7 250 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA2013Q8IYS2 634 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF333Q96JL9 665 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MTMR6Q9Y217 621 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 UTYO14607 1347 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A17O43808 307 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ACTN2P35609 894 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 NHLH1Q02575 133 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 OLIG2Q13516 323 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TSSK4Q6SA08 328 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 SZRD1Q7Z422 152 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TICAM1Q8IUC6 712 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 TAGAPQ8N103 731 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 CADM3Q8N126 398 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RNF183Q96D59 192 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 BBS4Q96RK4 519 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 NCAPGQ9BPX3 1015 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRC-212ENST00000491302 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.05□□□□□ -1.12
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