RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 FADS3Q9Y5Q0 445 aa16.5■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1B0GTW7 788 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRD1A4D1F6 860 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC72A6NJI9 287 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGAP33O14559 1287 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC7A4O43246 635 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PALMO75781 387 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT7P08729 469 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CCR5P51681 352 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LIMK1P53667 647 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ARHGAP8P85298 464 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SEMG2Q02383 582 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PDK2Q15119 407 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SPA17Q15506 151 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 MFSD7Q6UXD7 560 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CAMK1DQ8IU85 385 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LZTR1Q8N653 840 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PLD5Q8N7P1 536 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KNL1Q8NG31 2342 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 NETO1Q8TDF5 533 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT35Q92764 455 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 FZD3Q9NPG1 666 aa16.49■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1W2PQU0 124 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 A0A1W2PR77 199 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PJA2O43164 708 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 IGSF6O95976 241 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT1P04264 644 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PRKCGP05129 697 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 TIMP2P16035 220 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PRLRP16471 622 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CR2P20023 1033 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 NEK3P51956 506 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 MAXP61244 160 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GALNT2Q10471 571 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LBRQ14739 615 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF284Q2VY69 593 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF805Q5CZA5 627 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SRLQ86TD4 932 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CEP76Q8TAP6 659 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 MYOCQ99972 504 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 HERPUD2Q9BSE4 406 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 DTLQ9NZJ0 730 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.48■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 H0Y8X5 98 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 RAD51BO15315 384 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KRT10P13645 584 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 VAV2P52735 878 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PTPRRQ15256 657 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 TAZQ16635 292 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KIF19Q2TAC6 998 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC38Q5VT99 294 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 TRIM69Q86WT6 500 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 RHOT1Q8IXI2 618 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 MINDY1Q8N5J2 469 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 KDM4CQ9H3R0 1056 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM9BQ9NQ34 198 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 DONSONQ9NYP3 566 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.47■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GIPC1O14908 333 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 AREL1O15033 823 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC31A1O15431 190 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SPOPO43791 374 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 GNSP15586 552 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 DPP6P42658 865 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CDKN2BP42772 138 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC1A1P43005 524 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 HORMAD1Q86X24 394 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PSKH2Q96QS6 385 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 PREBQ9HCU5 417 aa16.46■□□□□ 0.23
PTPRVP-202ENST00000490575 DYRK4Q9NR20 520 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms