RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 FBXL19Q6PCT2 694 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 Q6ZVU0 165 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 C11orf74Q86VG3 221 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF567Q8N184 647 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RAB7BQ96AH8 199 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CLDN23Q96B33 292 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CHRDQ9H2X0 955 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.87□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 WASH3PC4AMC7 463 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NEMP1O14524 444 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SIN3BO75182 1162 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MT-CO1P00395 513 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 EPOP01588 193 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TUBBP07437 444 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ITIH2P19823 946 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CD86P42081 329 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 WASP42768 502 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PDE1BQ01064 536 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 C2orf54Q08AI8 447 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ELP6Q0PNE2 266 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 GPS1Q13098 491 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PTK6Q13882 451 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ARTNQ5T4W7 220 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 EMC10Q5UCC4 262 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 USP45Q70EL2 814 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FBXL6Q8N531 539 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NETO2Q8NC67 525 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FRS2Q8WU20 508 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 RMDN1Q96DB5 314 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SPACA7Q96KW9 195 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PRRX2Q99811 253 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CARD6Q9BX69 1037 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 FOXQ1Q9C009 403 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 USP29Q9HBJ7 922 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.86□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 EFCAB8A8MWE9 144 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 K7ERQ8 282 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SLC7A4O43246 635 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-DQB2P05538 268 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 APRTP07741 180 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-EP13747 358 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 VAV1P15498 845 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NFKB1P19838 968 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 HLA-DPA1P20036 260 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 PRKCHP24723 683 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 KCNJ1P48048 391 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 GRIA4P48058 902 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NUMBP49757 651 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NEK3P51956 506 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MAXP61244 160 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 CDK18Q07002 472 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 WASHC5Q12768 1159 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ZBTB17Q13105 803 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ARMC3Q5W041 872 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 USP30Q70CQ3 517 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TTC7BQ86TV6 843 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 HOOK3Q86VS8 718 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTPS1-210ENST00000486889 TP53INP2Q8IXH6 220 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms