RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 UGT2B4P06133 528 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 JUPP14923 745 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TNFAIP3P21580 790 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DGKAP23743 735 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 MSNP26038 577 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ABL2P42684 1182 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ILKQ13418 452 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FGL2Q14314 439 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 Q6ZSR6 202 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RASA4BC9J798 803 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FFAR2O15552 330 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RASA4O43374 803 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 POP4O95707 220 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 IGSF6O95976 241 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ALPPL2P10696 532 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CLDN6P56747 220 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RAD51Q06609 339 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 CYP4F3Q08477 520 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SGCGQ13326 291 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ASIC2Q16515 512 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 MYLK3Q32MK0 819 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PROX2Q3B8N5 592 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PARP15Q460N3 678 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 HES3Q5TGS1 186 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SLC25A45Q8N413 288 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 OR4C6Q8NH72 309 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 BAP1Q92560 729 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 NXPE2Q96DL1 559 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 IFT43Q96FT9 208 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 HMCESQ96FZ2 354 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 BMFQ96LC9 184 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TAS2R14Q9NYV8 317 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ITM2BQ9Y287 266 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RAXQ9Y2V3 346 aa14.54□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 POM121BA6NF01 834 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 IGLON5A6NGN9 336 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC53A6NM62 1247 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 WASH4PA8MWX3 477 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TRIM38O00635 465 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 FPGTO14772 594 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RAD51BO15315 384 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SIGLEC6O43699 453 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PIAS2O75928 621 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ACP1P24666 158 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RABIFP47224 123 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TPI1P60174 286 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 RHOAP61586 193 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DAB2P98082 770 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 OGDHQ02218 1023 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SERINC3Q13530 473 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 SYT11Q9BT88 431 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 KLC2Q9H0B6 622 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GPR27Q9NS67 375 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 PARVAQ9NVD7 372 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GGT7Q9UJ14 662 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.53□□□□□ -0.08
ATG4B-218ENST00000479554 H3BM21 787 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 SPINT1O43278 529 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PSMA2P25787 234 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 HTR7P34969 479 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 C19orf48Q6RUI8 117 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 TTC7BQ86TV6 843 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 PARGQ86W56 976 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 NETO2Q8NC67 525 aa14.52□□□□□ -0.09
ATG4B-218ENST00000479554 ASB12Q8WXK4 309 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms