RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	DMTF1	Q9Y222	760 aa		15.02	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	ITM2B	Q9Y287	266 aa		15.02	■□□□□ -0
SSR4-208	ENST00000471880	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	15.02	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	INSIG1	O15503	277 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF11	O60813	436 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PIGN	O95427	931 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	WNT1	P04628	370 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	AKT2	P31751	481 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	CTSK	P43235	329 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	MMRN1	Q13201	1228 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SGCG	Q13326	291 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SLC14A1	Q13336	389 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	DPYS	Q14117	519 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	CYTH1	Q15438	398 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC157	Q569K6	752 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ODF2	Q5BJF6	829 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SARM1	Q6SZW1	724 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	LZTR1	Q8N653	840 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	KCTD6	Q8NC69	237 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TEKT4	Q8WW24	435 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	FEM1C	Q96JP0	617 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	LHX3	Q9UBR4	397 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		15.01	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SPEG	Q15772	3267 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TLR4	O00206	839 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	LAT	O43561	262 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	MAGEC1	O60732	1142 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	GJB3	O75712	270 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PROSC	O94903	275 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM253	P0C7T8	217 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINB6	P35237	376 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT1	P36639	197 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ABL2	P42684	1182 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	HCAR3	P49019	387 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN2	P57739	230 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF235	Q14590	738 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	NEK5	Q6P3R8	708 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PLPP6	Q8IY26	295 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	GGT7	Q9UJ14	662 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		15	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	NEBL	O76041	1014 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ITGAV	P06756	1048 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	CD48	P09326	243 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	THEGL	P0DJG4	465 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF75D	P51815	510 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	FAM193A	P78312	1265 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	IL10RB	Q08334	325 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF284	Q2VY69	593 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	INAVA	Q3KP66	663 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PIP4P1	Q86T03	277 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PDF	Q9HBH1	243 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	NENF	Q9UMX5	172 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP13	Q12802	2813 aa		14.99	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	PTPRB	P23467	1997 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PR77	199 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	IGLON5	A6NGN9	336 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	FLRT2	O43155	660 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN6	O43657	245 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	MAP3K6	O95382	1288 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	KRT7	P08729	469 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF883	P0CG24	379 aa		14.98	□□□□□ -0.01
SSR4-208	ENST00000471880	ITIH2	P19823	946 aa		14.98	□□□□□ -0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms