RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470199.2

LMNA-211, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 4

Gene LMNA, Length 551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3EA0A087X179 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3LB9A6J9 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SPINT1O43278 529 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3HP0C7X1 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PYGMP11217 842 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ITGB7P26010 798 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ABL2P42684 1182 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZNF805Q5CZA5 627 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZSWIM9Q86XI8 627 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SYT12Q8IV01 421 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TEX26Q8N6G2 289 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CCNYQ8ND76 341 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 MAML1Q92585 1016 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 FOXJ1Q92949 421 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 OLFM3Q96PB7 478 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TSGA13Q96PP4 275 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 HDAC8Q9BY41 377 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 NT5MQ9NPB1 228 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 DYRK4Q9NR20 520 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 GGT7Q9UJ14 662 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ITM2BQ9Y287 266 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SPAG17Q6Q759 2223 aa18.08■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CCDC66A2RUB6 948 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 LRRC72A6NJI9 287 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 WNT9AO14904 365 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 MATN3O15232 486 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 KRT86O43790 486 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZNF806P0C7X5 589 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ADRB3P13945 408 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CR2P20023 1033 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CCNCP24863 283 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 MMP13P45452 471 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SCNN1BP51168 640 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 RWDD2BP57060 319 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZNF235Q14590 738 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 IHHQ14623 411 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CSRP2Q16527 193 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 MARC1Q5VT66 337 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 LRRC49Q8IUZ0 686 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 C1orf216Q8TAB5 229 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 KLK6Q92876 244 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 HDAC11Q96DB2 347 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PPP1R16AQ96I34 528 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 LRIG1Q96JA1 1093 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CEP41Q9BYV8 373 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TSGA10Q9BZW7 698 aa18.07■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 KCNK1O00180 336 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SLC7A4O43246 635 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 GDF9O60383 454 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PRKCGP05129 697 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TIMP2P16035 220 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CSNK1DP48730 415 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 NEK3P51956 506 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 IRX4P78413 519 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SEMG2Q02383 582 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZBTB17Q13105 803 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 TFDP2Q14188 446 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SYCP2LQ5T4T6 812 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 FBXL19Q6PCT2 694 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 CCDC13Q8IYE1 715 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SYCE1Q8N0S2 351 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 MGME1Q9BQP7 344 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 PCED1AQ9H1Q7 454 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 NOD2Q9HC29 1040 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 VPS45Q9NRW7 570 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 FADS3Q9Y5Q0 445 aa18.06■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 JCHAINP01591 159 aa18.05■□□□□ 0.48
LMNA-211ENST00000470199 HLA-DQB2P05538 268 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms