RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	CA12	O43570	354 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SPRY2	O43597	315 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PAGE4	O60829	102 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ERBB2	P04626	1255 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	IGFBP2	P18065	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PRPH2	P23942	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PSMA3	P25788	255 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MCM5	P33992	734 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF81	P51508	661 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CLCN2	P51788	898 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	UBXN1	Q04323	297 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PCLAF	Q15004	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GJB7	Q6PEY0	223 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	RAPH1	Q70E73	1250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006		Q8NFD4	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SNX21	Q969T3	373 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FNBP1	Q96RU3	617 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006		A0A1W2PQF6	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CEP104	O60308	925 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TACC1	O75410	805 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PMPCB	O75439	489 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	JTB	O76095	146 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GALT	P07902	379 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC175	P0C221	793 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PRR35	P0CG20	571 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SELL	P14151	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CREB1	P16220	341 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NDUFB7	P17568	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GABRB1	P18505	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FMO4	P31512	558 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GK	P32189	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GJC1	P36383	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HNF4A	P41235	474 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	LIG4	P49917	911 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	HDAC4	P56524	1084 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMF1	P82094	1093 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	IL13RA2	Q14627	380 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNOT10-208	ENST00000463006	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms