RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRC-210ENST00000462363 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
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PTPRC-210ENST00000462363 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
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PTPRC-210ENST00000462363 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf46Q6P387 395 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.71□□□□□ -1.5
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