RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441587.2

ALMS1-IT1-201, ALMS1 intronic transcript 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ALMS1-IT1, Length 2,107 nt, Biotype sense intronic.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CCDC63Q8NA47 563 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR6Y1Q8NGX8 325 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 INPP5DQ92835 1189 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MYRFLQ96LU7 910 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PKP4Q99569 1192 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CCDC77Q9BR77 488 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NUP85Q9BW27 656 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EBF2Q9HAK2 575 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC39A1Q9NY26 324 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KCMF1Q9P0J7 381 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 STX8Q9UNK0 236 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TIMM22Q9Y584 194 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 AGAP14A8MT82 685 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 H3BM21 787 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CA12O43570 354 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GFRA3O60609 400 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CYTIPO60759 359 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TPOP07202 933 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ANXA6P08133 673 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 INHBAP08476 426 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 LINGO3P0C6S8 592 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 GLRA2P23416 452 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TUFMP49411 452 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF81P51508 661 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IRAK1P51617 712 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ABATP80404 500 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ATP8B2P98198 1209 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CTBP1Q13363 440 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RCN2Q14257 317 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NKPD1Q17RQ9 610 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NFRKBQ6P4R8 1299 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 BEND4Q6ZU67 534 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NLRP9Q7RTR0 991 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MPP5Q8N3R9 675 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR1N1Q8NGS0 311 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF384Q8TF68 577 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TWNKQ96RR1 684 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RTKNQ9BST9 563 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ITPAQ9BY32 194 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CENPHQ9H3R5 247 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 AZI2Q9H6S1 392 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 OR6C2Q9NZP2 312 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TMOD2Q9NZR1 351 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 MORF4L1Q9UBU8 362 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TBX20Q9UMR3 447 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 POMT1Q9Y6A1 747 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.99□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 A0A1W2PQJ5 194 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF879B4DU55 563 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 E9PMD0 336 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 FAM229AH3BQW9 127 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PPEF2O14830 753 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ADAMTS2O95450 1211 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ABHD16AO95870 558 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 IL1R1P14778 569 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 WNT5AP41221 380 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PDE1AP54750 535 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ASIC1P78348 528 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 KDSRQ06136 332 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ELP6Q0PNE2 266 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 EPS8Q12929 822 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 CASP8Q14790 479 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PDK1Q15118 436 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 PTPAQ15257 358 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ZNF124Q15973 351 aa5.98□□□□□ -1.45
ALMS1-IT1-201ENST00000441587 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms