RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGAP17Q68EM7 881 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PPP4R4Q6NUP7 873 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ANKFN1Q8N957 763 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ANKRD52Q8NB46 1076 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RHOJQ9H4E5 214 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PRORSD1PA6NEY8 169 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM233B4DJY2 109 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NPHS1O60500 1241 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CBFA2T3O75081 653 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 COL6A2P12110 1019 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SAT1P21673 171 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJB1P25685 340 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PTPN3P26045 913 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GRM5P41594 1212 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC44A4Q53GD3 710 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CERCAMQ5T4B2 595 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 REP15Q6BDI9 236 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TFAP2CQ92754 450 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 XPR1Q9UBH6 696 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CDH7Q9ULB5 785 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 VARSP26640 1264 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RALGDSQ12967 914 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KCTD11Q693B1 232 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CHSY3Q70JA7 882 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NT5DC4Q86YG4 428 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CCNYL1Q8N7R7 359 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 APBA2Q99767 749 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CD300AQ9UGN4 299 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.09■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CITO14578 2027 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MMP3P08254 477 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FAM163BP0C2L3 166 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2C9P11712 490 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MATKP42679 507 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NPY2RP49146 381 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SULT1E1P49888 294 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RAB15P59190 212 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CCL15Q16663 113 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GIPC3Q8TF64 312 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RSPH1Q8WYR4 309 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 VPS50Q96JG6 964 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HIPK3Q9H422 1215 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF711Q9Y462 761 aa15.08■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FBP2O00757 339 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 BMP2P12643 396 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 CKMT2P17540 419 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 HMOX2P30519 316 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 SCN1AP35498 2009 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 AVPR1AP37288 418 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 RPL34P49207 117 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 BCAT1P54687 386 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 SQLEQ14534 574 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf10Q5SRN2 563 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2R1Q6VVX0 501 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 TNIP2Q8NFZ5 429 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 CROCCQ5TZA2 2017 aa15.08■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 GOLGA8TH3BQL2 631 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 SOCS2O14508 198 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 SUPT3HO75486 399 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 CYP2B6P20813 491 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 PGGT1BP53609 377 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 TSTD2Q5T7W7 516 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 KATNBL1Q9H079 304 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D23Q9NUY8 699 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.07■□□□□ 0
TOP3B-206ENST00000436282 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms