RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC39A12Q504Y0 691 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC157Q569K6 752 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FKBP15Q5T1M5 1219 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SDHAF4Q5VUM1 108 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPRG1Q6ZUI0 275 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLXDC1Q8IUK5 500 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 BRSK2Q8IWQ3 736 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC65Q8IXS2 484 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ELMOD1Q8N336 334 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 HVCN1Q96D96 273 aa4.72□□□□□ -1.65
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RPS3AP54-201ENST00000435535 SENP8Q96LD8 212 aa4.72□□□□□ -1.65
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDE11AQ9HCR9 933 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASAH2Q9NR71 780 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPS15L1Q9UBC2 864 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEL1LQ9UBV2 794 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDH7Q9ULB5 785 aa4.72□□□□□ -1.65
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RPS3AP54-201ENST00000435535 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.72□□□□□ -1.65
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A088AWK7 358 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM227AF5H4B4 570 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 M0QZQ0 153 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 F2RL2O00254 374 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYB561D2O14569 222 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLIC2O15247 247 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAMEF12O95522 483 aa4.71□□□□□ -1.66
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RPS3AP54-201ENST00000435535 ATF6P18850 670 aa4.71□□□□□ -1.66
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RPS3AP54-201ENST00000435535 GPC5P78333 572 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 RHDQ02161 417 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 CUL4BQ13620 913 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGAT5BQ3V5L5 792 aa4.71□□□□□ -1.66
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RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA1Q5VX52 437 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 WSCD1Q658N2 575 aa4.71□□□□□ -1.66
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RPS3AP54-201ENST00000435535 MTSS1LQ765P7 747 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.71□□□□□ -1.66
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RPS3AP54-201ENST00000435535 APPL2Q8NEU8 664 aa4.71□□□□□ -1.66
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RPS3AP54-201ENST00000435535 HDAC7Q8WUI4 952 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX21Q969T3 373 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC35A4Q96G79 324 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5C1BQ96P26 610 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 SARGQ9BW04 601 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM9Q9C026 710 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNMDQ9H2S6 317 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEBP1Q9NRV9 189 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.71□□□□□ -1.66
RPS3AP54-201ENST00000435535 EXOC1Q9NV70 894 aa4.71□□□□□ -1.66
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