RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 FAM72DQ6L9T8 149 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 FAM72BQ86X60 149 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 LSMEM2Q8N112 164 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 CCDC185Q8N715 623 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 BTN2A2Q8WVV5 523 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 NTAN1Q96AB6 310 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.6■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 AQP9O43315 295 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 BUB1O43683 1085 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 GJB6O95452 261 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 MYF5P13349 255 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 JUNDP17535 347 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 GPD1P21695 349 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 PTK2BQ14289 1009 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 SYCP1Q15431 976 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 SLFN11Q7Z7L1 901 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 TTC7BQ86TV6 843 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 IFI44Q8TCB0 444 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 MAPK15Q8TD08 544 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 KLHL32Q96NJ5 620 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 CAAP1Q9H8G2 361 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 NEU3Q9UQ49 428 aa20.59■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 CALB1P05937 261 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 THOP1P52888 689 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 PFN3P60673 137 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 EFHC2Q5JST6 749 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 GDPD4Q6W3E5 623 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 C3orf20Q8ND61 904 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 IL12RB2Q99665 862 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 MAGEB5Q9BZ81 275 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 SPASTQ9UBP0 616 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 GGT7Q9UJ14 662 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 ITM2BQ9Y287 266 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 U3KQA8 63 aa20.58■□□□□ 0.89
ELL3-202ENST00000433927 TK2O00142 265 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 TPP1O14773 563 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 AREL1O15033 823 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 EPHB6O15197 1021 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 SPINT1O43278 529 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 USP12O75317 370 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 CSO75390 466 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 TMCC1O94876 653 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 IGSF6O95976 241 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 EPHB2P29323 1055 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 YPEL5P62699 121 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 PTP4A2Q12974 167 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 WDR59Q6PJI9 974 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 ZNF248Q8NDW4 579 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 LMX1AQ8TE12 382 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 GLMNQ92990 594 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 CENPTQ96BT3 561 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 LGMNQ99538 433 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 KLF15Q9UIH9 416 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 BPTFQ12830 3046 aa20.57■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 CPED1A4D0V7 1026 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 ANKRD62A6NC57 917 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 TOR1BO14657 336 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 TM7SF2O76062 418 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 MPOP05164 745 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 LSSP48449 732 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 RHOAP61586 193 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 GABREP78334 506 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 CDKN3Q16667 212 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 GPR155Q7Z3F1 870 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 NEK11Q8NG66 645 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.56■□□□□ 0.88
ELL3-202ENST00000433927 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms