RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIK4Q16099 956 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPSLQ8WWF8 208 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CHID1Q9BWS9 393 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CATSPERZQ9NTU4 200 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ERGIC3Q9Y282 383 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM38O00635 465 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ULK1O75385 1050 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 DPEP1P16444 411 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMB4P28070 264 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2C18P33260 490 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CRATP43155 626 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 POLLQ9UGP5 575 aa11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 LACTBL1A8MY62 500 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GRIN3BO60391 1043 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINA4P29622 427 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RPL22P35268 128 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 LSM3P62310 102 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 DEPDC4Q8N2C3 294 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJB3Q8WWF6 145 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF112Q9UJU3 913 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXO10Q9UK96 956 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 AK5Q9Y6K8 562 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NFASCO94856 1347 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2QL1A1L167 161 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZMPSTE24O75844 475 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINA1P01009 418 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ABHD2P08910 425 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TSHRP16473 764 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCN5P51795 746 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP3CAQ08209 521 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SQLEQ14534 574 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GCNT7Q6ZNI0 430 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 DSG4Q86SJ6 1040 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PRELID2Q8N945 189 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP3R2Q96LZ3 170 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NLNQ9BYT8 704 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 COMMD9Q9P000 198 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX6Q9UNH7 406 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A087X0B3 334 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 MLYCDO95822 493 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SHBGP04278 402 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF286BP0CG31 522 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NTSP30990 170 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TUFMP49411 452 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NR1D2Q14995 579 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF540Q8NDQ6 660 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ELMO1Q92556 727 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 UBE2E3Q969T4 207 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 Q96MT0 163 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.09□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM150BA6NC51 233 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 NUDT17P0C025 328 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ACADMP11310 421 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CKBP12277 381 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 HGFP14210 728 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF24P17028 368 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 GSTM5P46439 218 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CRADDP78560 199 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ACOX1Q15067 660 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNK18Q7Z418 384 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ATL1Q8WXF7 558 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 HSFY1Q96LI6 401 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 ACSS3Q9H6R3 686 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD7Q9NQZ5 370 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 CLN6Q9NWW5 311 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 COQ6Q9Y2Z9 468 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.08□□□□□ -0.63
EFTUD2-202ENST00000426333 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC189A1A4V9 331 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 EML1O00423 815 aa11.08□□□□□ -0.64
EFTUD2-202ENST00000426333 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms