RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO27Q8NI29 283 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIPC2Q8TF65 315 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NSMCE1Q8WV22 266 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTPALQ9BTX7 342 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C15orf41Q9Y2V0 281 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACOT9Q9Y305 439 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.92■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PITPNM1O00562 1244 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HOXA2O43364 376 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL6A2P12110 1019 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATF6P18850 670 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAJB1P25685 340 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL10RBQ08334 325 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF460Q14592 562 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PARP15Q460N3 678 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NADSYN1Q6IA69 706 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NEPROQ6NW34 567 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMPRSS6Q8IU80 811 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC8Q8TAM2 541 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RANBP9Q96S59 729 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM175Q9BSA9 504 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO5Q9UKT4 447 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STMN1P16949 149 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLRBP48167 497 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD151P48509 253 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERINC3Q13530 473 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCN5AQ14524 2016 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGBD5Q8N414 524 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GIMAP7Q8NHV1 300 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STYXQ8WUJ0 223 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH19Q9H159 772 aa18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC38A8A6NNN8 435 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYL4P12829 197 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR1E1P30953 314 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP4Q13107 963 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LIPMQ5VYY2 423 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA0408Q6ZU52 694 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARRDC2Q8TBH0 407 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TADA1Q96BN2 335 aa18.9■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAPKAPK2P49137 400 aa18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGAP24Q8N264 748 aa18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCYL1Q96KG9 808 aa18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TTLL2Q9BWV7 592 aa18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TARM1B6A8C7 271 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AURKAO14965 403 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DIAPH2O60879 1101 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLHL2O95198 593 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TPBGLP0DKB5 382 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TACR2P21452 398 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRABP2P29373 138 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PGM1P36871 562 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACVRL1P37023 503 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ETFBP38117 255 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNQ1P51787 676 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TAS2R39P59534 338 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPATCH11Q8N954 259 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR13J1Q8NGT2 312 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR78Q96P69 363 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COG4Q9H9E3 785 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XPR1Q9UBH6 696 aa18.89■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAM12O43184 909 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ELF1P32519 619 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRKAA2P54646 552 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTA1Q13330 715 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LBRQ14739 615 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIRPB2Q5JXA9 342 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNSTQ6PJW8 725 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPGNQ6UW88 154 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO22Q8NEZ5 403 aa18.88■□□□□ 0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALML6Q8TD86 181 aa18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms